菌种鉴定通过分析菌种的生物学特性、遗传信息以及生理生化反应等，来确定菌种的种类和归属。
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菌种鉴定范围
食品：肉类、蔬菜、水果、饮料等；
环境：水质、空气、土壤、沉积物等；
医药：药品、原料药、中药、保健品等；
日用品：化妆品、清洁用品、洗涤用品、一次性卫生用品等；
工业品：纺织材料及制品、陶瓷及制品、塑料及制品、电气及电子产品等；
其他：生物制品、溶液等。
菌种鉴定内容
菌种鉴定内容有细菌、酵母、放线菌丝状真菌、沙门氏菌、大肠杆菌等；
菌种鉴定方法
菌种鉴定方法包括但不局限于形态学观察、生理生化特性鉴定、 BIOLOG碳源自动分析鉴定、分子生物学鉴定、API细菌数值鉴定、功能性分析及功能基因、RAPD、SSCP、TLC薄层层析、全细胞脂肪酸分析鉴定、（G＋C）mol％测定、DNA/DNA同源性测定等。
菌种鉴定流程
基因组DNA提取→通用引物PCR扩增→PCR产物回收→测序或克隆测序→数据库对比
菌种鉴定机构
hth登录入口网页 采用DNA 测序对微生物进行物种鉴定（菌种鉴定），这种鉴定方法比传统生化鉴定更、更快速、更准确的鉴定方法。DNA 测序不依赖菌种本身特点，对所有菌种均可使用。我们菌种鉴定服务包括细菌16s rDNA鉴定和真菌26s rDNA鉴定、真菌ITS和真菌18s 鉴定。
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